El territorio que hoy ocupa la comuna era habitado por los complejos culturales Bato, Llolleo y posteriormente, Aconcagua. Al menos dos hallazgos de osamentas se han encontrado en el sector de Lonquén. Uno con un ajuar consistente en jarros y ollas de superficie gris alisada, posiblemente del período agroalfarero tardío (1.200 a 1.450) y otro en la localidad San Antonio de Naltagua, cuyos restos datan de los años 900 y 1470.
A la llegada de los españoles, la actual Isla de Maipo era comandada por el curaca inca Tala Canta (Talagante), con quien los hispanos acordaron el intercambio de bienes, especialmente maderas y mano de obra.
